Il CDS San Ciro è centro di riferimento per l'ASL Napoli 3 Sud dell'importante progetto dell’Osservatorio campano Resistenze Antibiotici, frutto di un protocollo d’intesa con l’Università degli studi di Milano, l'ASL Napoli 3 Sud, l'Istituto Zooprofilattico Sperimentale del Mezzogiorno e alcuni laboratori distrettuali, che hanno dichiarato guerra ai «super batteri».